深圳证券交易所目前实行的是中国证券登记结算有限责任公司深圳分公司(以下简称“中国结算深圳分公司”)统一托管和证券营业部分别托管的二级托管制度，又称托管券商制度。即，中国结算深圳分公司统一存管投资者的证券资产和相关资料，办理相关证券存管业务；同时，由证券营业部为托管券商设立证券托管库，负责托管所属客户的证券资产及相关资料，办理有关查询挂失等业务。

目前托管券商制度可概括为：自动托管，随处通买，哪买哪卖，转托不限。即，深圳市场的投资者持有的证券需在自己选定的证券营业部托管，由证券营业部管理其名下明细证券资料。投资者的证券托管是自动实现的。投资者在任一证券营业部买入证券，这些证券就自动托管在该证券营业部。投资者可以利用同一证券账户在国内任一证券营业部买入证券。投资者要卖出证券必须到证券托管营业部方能进行(在哪里买入就在哪里卖出)。投资者也可以将其托管证券从一个证券营业部转移到另一个证券营业部托管，称为证券转托管。转托管可以是一只证券或多只证券，也可以是一只证券的部分或全部。投资者在原托管证券营业部申请办理转托管，营业部报盘至证券交易所，证券交易所在当天(T日)进行处理，并将处理结果传送给转出证券营业部和转人证券营业部。投资者于第二个交易日(T+1日)就可以在转人证券营业部(新的托管证券营业部)卖出证券。

投资者办理证券转托管的具体程序如下：
1.投资者在确定转入证券营业部的席位代码和地址后，携带身份证、证券账户原件及复印件，到转出证券营业部申请办理。
2.转出证券营业部受理投资者申请时，核对投资者的身份证、证券账户、转人证券营业部席位代码等内容，核对无误后，在投资者填写的转托管申请表上盖章确认，并将客户联交投资者。
3.转出证券营业部按照深圳证券交易所有关规定，在交易时间内申报转托管。转托管可以撤单。
4.每个交易日下午收市后，证券营业部接收中国结算深圳分公司传回的已确认和未确认转托管数据，据此调整相应证券明细数据。
5.转出证券营业部收到转托管未确认数据，可向中国结算深圳分公司查询转托管不成功原因。
6.转托管数据确认后的下一个交易日起，相应的证券托管再转入证券营业部。